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Intérêts de Recherche et Professionels

• Apprentissage Automatique
• Science des Données
• Traitement de la Langue Naturelle

Éducation

• M.Sc. en Informatique - Intelligence Artificielle

  Université Laval, Québec, 2018 à 2019.

• Ph.D. en Informatique

  Université Laval, Québec, 2016 -

  Dirigé par le Pr. François Laviolette.

• M.Sc. en Microbiologie-Immunologie

  Université Laval, Québec, 2013 à 2018

  Dirigé par le Pr. Jacques Corbeil, co-dirigé par le Pr. François Laviolette.

  Projet de mémoire: Amélioration de l’assurance de qualité des produits sanguins avec spectrométrie de masse à haut-débit et l’apprentissage automatique.

• B.Sc. en Bioinformatique

  Université Laval, Québec, 2010 à 2012

• B.Sc. en Biochimie

  Université Laval, Québec, 2008 -

Expérience

• Chercheur Scientifique, Co-operator’s Assurances Générales

  Juin 2021 - en cours. Exécution de projets en science des données et apprentissage automatique appliqué, particulièrement en vision, traitement de la langue et optimisation. Mise au point de formations de bonnes pratiques de programmation, ingénierie logicielle et utilisation de git.

• Chercheur Scientifique Associé, Co-operator’s Assurances Générales

  Janvier 2020 - Juin 2021. Exécution de projets en science des données et apprentissage automatique appliqué, particulièrement en vision, traitement de la langue et optimisation. Mise au point de formations de bonnes pratiques de programmation, ingénierie logicielle et utilisation de git.

• Stagiaire MITACS en Intelligence Artificielle, Can-Explore

  Mai 2019 - Novembre 2019.

• Auxiliaire d’Enseignement, Université Laval

  Janvier 2017 - Avril 2019. Correction d’examens pour les cours GLO-2100 Algorithmes et structures de données (2017-2019) et pour GLO-4027 Traitement de données massives.

• Instructeur de Tutoriel Pratique, Introduction au prétraitement des données de spectrométrie de masse et à l’apprentissage automatique, École d’Été en Microbiomes - Big Data Analytics for Omics Science.

  Juin 2017, Université Laval. Lien

• Participant au Hackathon Hacking Health Québec 2016.

  Octobre 2016, Université Laval.

• Auxiliaire de Recherche / Stagiaire, IBIS, Université Laval

  Janvier 2011 - Mai 2013, Laboratoire du Pr. Nicolas Derome.

Publications et Communications

Publications

• Francis Brochu. Increasing Shape Bias in ImageNet-Trained Networks Using Transfer Learning and Domain-Adversarial Methods. arXiv preprint.
• Francis Brochu, Pier-Luc Plante, Alexandre Drouin, Dominic Gagnon, Dave Richard, Francine Durocher, Caroline Diorio, Mario Marchand, Jacques Corbeil, and François Laviolette. Mass spectra alignment using virtual lock-masses. Scientific Reports, 9(1):8469, 2019.
• Jean-Guillaume Emond-Rheault, Antony T Vincent, Mélanie V Trudel, Francis Brochu, Brian Boyle, Katherine H Tanaka, Sabrina A Attéré, Éric Jubinville, Thomas P Loch, Andrew D Winters, et al. Variants of a genomic island in aeromonas salmonicida subsp. salmonicida link isolates with their geographical origins. Veterinary microbiology, 175(1):68–76, 2015.
• Steve J Charette, Francis Brochu, Brian Boyle, Geneviève Filion, Katherine H Tanaka, and Nicolas Derome. Draft genome sequence of the virulent strain 01-b526 of the fish pathogen aeromonas salmonicida. Journal of bacteriology, 194(3):722, 2012.

Communications

• Présentation orale à la Great Lakes Bioinformatics Conference (GLBIO) 2017, à Chicago, Il. en Mai 2017. Virtual Lock Masses: an algorithmic method to enable mass spectra comparison in untargeted studies. Brochu F, Plante PL, Drouin A, Laviolette F, Marchand M, Corbeil J.

• Poster à 64th ASMS Conference on Mass Spectrometry and Allied Topics, à San Antonio, Tx en Juin 2016. Virtual Lock Masses: an algorithmic method to enable mass spectra comparison in untargeted studies. Brochu F, Plante PL, Drouin A, Laviolette F, Marchand M, Corbeil J.